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一抗的選擇

[2012/11/27]

  檢測(cè)任何目的靶蛋白都有不止一種抗體可供選擇,為縮小抗體的選擇范圍選中合適的抗體,需要考慮如下幾種因素:

  分析試驗(yàn)應(yīng)用的類型l

  樣本蛋白的結(jié)構(gòu)性質(zhì)l

  樣本的種屬l

  抗體宿主的種類l

  抗體的標(biāo)記和檢測(cè)l

  1.分析試驗(yàn)應(yīng)用的類型

  一般抗體說(shuō)明書(shū)都列出該抗體經(jīng)試驗(yàn)驗(yàn)證過(guò)適用于何種分析類型,如:可以應(yīng)用于WB IHC ICC ELASA分析等,如果抗體說(shuō)明書(shū)沒(méi)有提及的應(yīng)用類型,并不意味著該抗體不適用于此種分析應(yīng)用類型,而僅是說(shuō)明尚未經(jīng)過(guò)此種分析試驗(yàn)驗(yàn)證,如果抗體不適用某些分析試驗(yàn),則會(huì)在抗體說(shuō)明書(shū)上標(biāo)注出來(lái)不適于某分析試驗(yàn)。

  2.樣本蛋白的結(jié)構(gòu)性質(zhì)

  了解樣本蛋白的結(jié)構(gòu)性質(zhì)有助于選擇最合適的抗體,至少兩方面因素需要考慮

  待測(cè)樣本蛋白的結(jié)構(gòu)域:抗體是由各種不同免疫原免疫宿主而制備得來(lái),其中的免疫原包括:全長(zhǎng)蛋白、蛋白片斷、多肽、全有機(jī)體(如:細(xì)菌)或細(xì)胞,抗體說(shuō)明書(shū)一般都有免疫原的描述,如果打算檢測(cè)的是蛋白片斷或一種特殊的同型物或蛋白全長(zhǎng)的某一區(qū)域,則必須選擇用含此片段域的免疫原制備出的抗體。如果打算用FACS流式檢測(cè)活細(xì)胞的表面蛋白,則需要選擇含該表面蛋白的胞外域來(lái)免疫制備的抗體。l

  樣本的提取或處理過(guò)程:某些抗體要求樣本經(jīng)過(guò)某些特殊處理,例如:許多抗體只識(shí)別還原和變性的、表位已暴露不受二級(jí)四級(jí)結(jié)構(gòu)阻礙的蛋白樣本,另一方面,某些抗體僅識(shí)別天然折疊狀態(tài)的蛋白。當(dāng)選擇免疫組化的抗體時(shí),應(yīng)注意某些抗體只識(shí)別未固定的冷凍的組織,而另一些抗體則適用于無(wú)需抗原修復(fù)解交聯(lián)步聚的甲醛固定石蠟包埋的組織,這些都會(huì)在抗體說(shuō)明書(shū)上應(yīng)用部分標(biāo)示出來(lái)l

  3.樣本的物種

  應(yīng)選擇物種相同或有交叉反應(yīng)的抗體,抗體可能與不同物種的同種靶蛋白有交叉反應(yīng),因其氨基酸序列同源性較高,如果樣本的種類未列入抗體說(shuō)明書(shū)上的交叉反應(yīng)種屬表中,并不意味著該抗體不適用于檢測(cè)該物種的蛋白,而只是表示該物種尚未用此抗體檢測(cè)驗(yàn)證過(guò),應(yīng)通過(guò)序列比對(duì)的方法來(lái)預(yù)測(cè)交叉反應(yīng),可應(yīng)用Expasy 和 NCBI BLAST來(lái)進(jìn)行不同物種蛋白同源性比對(duì)。

  4.一抗宿主物種的選擇

  一般說(shuō)來(lái),在使用偶聯(lián)二抗結(jié)合無(wú)偶聯(lián)物的一抗時(shí),一抗宿主動(dòng)物的物種選擇較為重要,對(duì)于免疫組化而言,盡可能選擇與樣本不同種系物種的一抗,從而避免二抗與樣本內(nèi)源性免疫球蛋白產(chǎn)生交叉反應(yīng),例如:檢測(cè)小鼠樣本蛋白,則不應(yīng)選擇小鼠或大鼠源的一抗,最好選兔源的一抗,則二抗則可選擇偶聯(lián)了檢測(cè)分子(酶、熒光素、生物素等)的抗兔IgG。如果選擇有偶聯(lián)物的一抗則不適用上述情況,除免疫組化外的其它對(duì)不含內(nèi)源性免疫球蛋白樣本的檢測(cè)方法,則抗體宿主物種的影響不大,如對(duì)不含IgG的細(xì)胞裂解物樣本的western blotting檢測(cè),盡管如此,含有血清的組織裂解物和組織培養(yǎng)上清中含有免疫球蛋白,還原變性樣本中含IgG,在western blot檢測(cè)中則結(jié)合出現(xiàn)IgG分子50 and 25 kDa的重鏈和輕鏈條帶。

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